Можно ли через модуль интеграции определить статус/состояние СОМ-порта?

Что конкретно вы имеете ввиду под "Состоянием" ком порта?

Активен - галочка стоит
Не активен - галочка снята.
---
поскольку у ядра опроса нет возможности иметь тупое описание на СОМ-порту - вынуждены вести текстовый файлик в котором прописано на какой порт откуда и чего валится.
Если такая возможность есть - уже готов попробовать шабашников нанять...

Видимо я вас не понимаю.
Эти галочки не несут никакой информационной нагрузки. Порты добавленные в АБД Орион про должны быть активны, недобавленные неактивны. Если это не происходит - значит или проблема с портом, или проблема с базой данных и не происходит корректной загрузки.
Если вернуться к галочкам - наличие таковых совершенно не гарантирует опрос по порту. Значимым событием является нахождение\потеря устройств на порту и соответственно их состояние. Эту информацию можно получать через предоставляемое ядром API модуля управления: http://bolid.ru/production/orion/po-orion/po-integration/modul_upr_s2000.html
Ознакомьтесь с документацией к этому продукту.

Модуль управления - продукт известный. Спасибо.