Либо создавайте новый УД для этого человека, в котором будет и старая дверь и новая, либо на вкладке пароли найдите этого персонажа и назначьте упрощенный УД, ниже в этом же поле накидайте ему произвольно дверей. 

Конфигурация считывается один раз, ну или после изменения конфигурации контроллера через uprog, новые карты, уровни и прочее записывается сразу и автоматически, если конечно в свойствах карты стоит хранить ключ в приборах. Зачем вы каждый раз конфигурацию читаете?

потому что когда-то пусконаладчик так сделал, это записали в блокноте и теперь так делают, ибо САМ так делал и у него после этого заработало))

вот тоже убивает это количество УД, и главное ограничиваешь доступ ко вкладке с УД, а потом люди думают, а что в том УД доступно и какой лучше выбрать, название то УД уже давно слабоинформативно.

Несколько уровней доступа в Орионе-Про пропуску назначить невозможно.
Добавить одну дверь непосредственно пропуску невозможно.
Только изменение уровня доступа, и никак иначе.
В Орионе-ПРО после первого считывания конфигурации из контроллеров на компьютере данные кэшируются, и при работе с ключами, при изменении уровней доступа, ядро опроса сравнивает кэшированную конфигурацию из контроллеров с той, что свежезапрограммирована в базе данных.
Итак, по команде "Получить состояние ключей" ключи, по которым, по мнению Ядра опроса между кэшем данных из контроллеров и между базой данных есть различия - подсвечиваются красным, и можно посмотреть подробности этих различий, в каком контроллере ключ есть, но должен быть заблокирован, в каком контроллере ключа нет, но должен быть добавлен.
Теперь по команде Синхронизировать можно эту разницу ликвидировать, либо для одного ключа, либо для всех сразу.
Ваш настройщик либо не знал о такой возможности, либо уходил от возможных проблем, то орион глюканёт, то связь, делаешь всё верно, а ключи не перепрограммируются.