Адреса интерфейсов RS232 и RS485 Вы имеете в виду? Они могут быть одинаковыми, они не связаны между собой. Да и на программу это влиять никак не должно.
Попробуйте сделать модернизацию, если нет привязки к индексам в базе (для интеграции например), либо создать вторую базу и восстановить ее из бекапа первой. Ну и на крайний случай пересустановитть полностью Орион, хотя на этот счет сомневаюсь.

Не магия. Ты же не просто машешь возле сервера бумажкой с надписью модернизация, процедура модернизации создаёт новую базу, при создании проверяет все связи и восстанавливает недостающее, если это возможно. 
А ещё круче слияние. Твоя существующая кривая база сливается с новенькой пустой, тут вообще всё новому строится. Я раз в полгода смотрю на то, что сломалось ночью, и либо восстановление из бэкапа (но не факт, что эта кривизна не попала в бэкап неделю назад), либо слияние.