Что-то много преобразователей интерфейсов в данной цепочке. Можно было сделать так: АРМ ОРИОН ПРО --->ЛВС--->C2000Ethernet--(RS232)--C2000M--(485)-->приборы. Скорее всего большая задержка сигнала от С2000М до АРМ Орион Про.
Обновить БД в Оперативной задаче пробовали?

Согласен. Но Пульт и ethernet в разных зданиях (по проекту) и между ними > 500 метров. Да БД обновляли. Да че там БД полностью комп перезагружали( 

Я централизованное управление никогда не включаю. По идее, если в ядре опроса видно, что с С2000М идет обмен, то должно все работать. Единственное что могу посоветовать, адрес самого пульта по RS-485 и RS-232 сделать одинаковым, например, 126. Т.е. он должен отличаться от адресов КДЛ, БИ, СП1 и т.д.. Соответственно, и в АБД указать тоже адрес пульта 126. Конечно, было бы лучше выложить скриншот конфигурации в АБД, а то так на словах не очень представляется картина.
А насчет обновления версии пульта, то желательно обновить, но не обязательно.
Кстати скорость в С2000-Ethernet какая выставлена? И какой протокол работы (Орион или Орион Про)?

Производилась ли настройка таймингов в пульте и компьютере?Утилиты RS485Settings и RSSettings соответственно.

Посмотрите в этикетке C2000-Ethernet, для разных режимов по разному но все довольно просто, или напишите хотябы в каком режиме Ethernet установлены. Поскольку пульт приязан к приборам напрямую его настройки скорее всего менять  не нужно.

Устройство организации обмена сприборами С2000-ethetnet (повесить на конкретный виртуальный порт и настраивать его)
Тайм аут квитанции 80мс (в эзернете установить)
Тайм аут ожидания запроса 130мс
Тайм-аут ожидания команд 700мс
Тайм-аут передачи по локальной сети 100мс
порт UDP 4000 установить и там и там
как-то так
и ПИ который сразу после эзернета можно убрать.