Смотря для чего используется система, от этого нужно плясать.
Стандартная скорость протокола Орион это 9600 т.е в секунду около 35 команд по моему, точно не помню. Получается чем больше приборов на одном СОМ порту, тем медленее работает система. Допустим разделим мы определенное количество пультов на две равные части и посадим на разные СОМ порты, то получается они будут опрашиваться в паралельном потоке, т.е паралельно, а не в одном. Отклики ядра опроса будут быстрее. Соответсвенно система будет, говоря образно работать в два раза быстрее. Это будет хорошо заметно при использовании таких модулей как "персональная карточка" где нам нужно что бы при прикладывание карты или ключа, мгновенно выскакивала фотография сотрудника на мониторе, но также скорость можно увеличить путем изменения скорости опроса в проколе.
Ко всему этому, если разбить на несколько СОМ портов, то в системе повышается общая надежность.
Выводы каждый для себя сделает сам.

Благодарю за развернутые коментарии, очень помогло в понимании сути. Но позвольте немного развить тему. 
Какой метод увеличения количества СОМ портов Вы считаете наиболее приемлемым, или какое оборудование для этого лучше использовать? 

Самыми лучшими СОМ портами являются -железные, .т.е плата с портами вставленная в ПК.