Это нормальное количество сотрудников., скуд чихнет и не заметит.
ОСНОВНАЯ ПРОБЛЕМА с количеством точек доступа и количеством вариантов уровней доступа.
Импорт сотрудников это "несовершенный" продукт, а учитывая неточности в документации...
Рекондую вручную создать 2-3 сотрудников. и поиграться с экспортом сотрудников... формат будет более понятен... но устите, что в экспорте будет 6, а в импорте надо указывать "Служащий" (простите это по памяти)
Утилита одноразовая. Два раза не используйте - будет плодить компании, подразделения и должности (там в принципе нет проверок на повторы) - тупо заливается инфа и всё.
Если система уже действующая, то настоятельно рекомендую сделать импорт "в песочнице" - на ненастоящей (чистой) базе а затем подчистив все хвосты-ошибки сделать СЛИЯНИЕ баз (хотя там тоже есть где ошибиться).
Конкретно по Вашей ошибке - смогу только предположить, что, возможно, Вы не указали файл паролей. Он должен быть пренепременно, пусть пустой, но должен быть.
Можно так же посмотреть в документации (про структуру базы данных) к чему относится поле MN и проверить куда оно у вас в файлике пропало.

Если на вашем предприятии используется 1С, то как альтернативное решение предлагаю вам посмотреть новый продукт УРВ для 1С.
Все сотрудники уже внесены в 1С (либо бухгалтерией, либо отделом кадров).
Карточки доступа могут выдаваться (забираться) непосредственно в отделе кадров при приеме сотрудника на работу.
Возможность подключения удаленных филиалов.
И много других удобств.

Мы в Болиде используем именно этот продукт, у нас более 700 сотрудников и несколько филиалов.
Также есть успешные внедрения и на других проектах.