Прядок получения проходов такой:

1. События проходов получают контроллеры доступа С2000-2 и накапливают их в своей внутренней памяти. Каждый контроллер может хранить в своей памяти примерно до 32000 событий.
2. Служба Orion2-Interface подключается к контроллерам доступа по сети и устанавливает с ними обмен данными. События проходов по-прежнему находятся в контроллерах доступа С2000-2.
3. Программа УРВ для 1С устанавливает соединение с сервисом Orion2-Interface по сети, открывает канал передачи данных и указывает сервису список контроллеров доступа, с которыми она будет работать.
4. Orion2-Interface обращается к указанным контроллерам доступа, вычитывает из них события проходов, то есть получает эти события и сразу же удаляет их из памяти контроллеров.  Далее, Orion2-Interface передаёт события проходов программе УРВ для 1С.

Когда программа УРВ для 1С закрывается,  канал связи с Orion2-Interface закрывается и события проходов снова накапливаются в контроллерах доступа.

>Можно ли параллельно считать события АРМ-ом С2000?
Нет.

>Какие рекомендации по выявлению проблемы можете дать?
Включить логи службы Orion2-Interface. Создать текстовый файл с расширением BAT и запустить его на выполнение.  Содержимое текстового файла такое:

Orion2srv.exe /install /silent /xmlrpclog
net start "Orion2"

Затем, вышлите в службу поддержки архив лог-файлов. Мы посмотрим в чём может быть проблема.