Глядя на цифру 450 я вспомнил, что ещё в СССР на информатике преподаватель ругал скорость моей программы, я его не понимал. Что вы имеете в виду? Вот же, быстро же работает. Он вздохнул и сказал, давайте начнём проверку с маленького миллиона записей.

Уточняющий вопрос. Вы хотите сказать, что под разными ID у вас записана одна и та же карта? Не четыре разных карты, а одна и та же? И Орион при попытке записать новую карту не ругался, что карта с таким номером уже записана в базу? Или же карту записывали только один раз, а затем при каком-то сбое она сама размножилась? 
Вопрос без сарказма, я такой же пострадавший, только у меня у одного человека по нескольку карт, потому что потерянные своевременно не удаляли, и теперь я не знаю, какие удалять, а какие оставить. 

В целом имею ту же проблему. Да, в базе две записи, одинаковые (в моем случае не совсем), с одним кодом. Если запросить состояние ключей, то одна сапись нормально показывает, а у второй всегда данные не известны. Но добавляются эти записи через модуль интеграции, видимо на каком то этапе что-то идет не так. Приходится вычищать эти записи вручную, ищу по id в базе данных, более новый считая как оригинал.

Да, човершенно верно, под разными ID у вас записана одна и та же карта и на одного и того же человека. Т.е. если я на вкладке "пароли" в поиске ввожу номер карты, то вываливается список одной и той же фамилии с одним и тем же номером картыкарты. Отличается только ID

В таком случае вопрос к тому человеку, который писал скрипт для работы с модулем интеграции. И этот человек у вас в конторе работает, а не в Болиде). Начать с выявления и устранения причины.